商家收款码在现代社会中被广泛应用于各类交易场景，因为它可以方便快捷地完成支付，无需现金和银行卡的介入。然而，作为商家使用收款码获取款项的一种方式，手续费问题也成为了人们关注的焦点。那么，一个商家收款码10000元时，需要扣除多少手续费呢？

首先，我们需要了解不同的支付方式可能涉及到的手续费率以及相关规定。根据不同的支付平台和商户签约协议，手续费率是有所不同的。一般而言，在国内，第三方支付平台如支付宝、微信支付等通常采取按照交易金额的百分比作为手续费。手续费率通常在0.5%至2%之间，具体金额会根据商户的交易额以及与第三方支付平台的协商而定。

假设商家收款码10000元，则按照0.5%至2%的手续费率来计算，手续费将在50至200元之间。根据这个范围，商家需要扣除的手续费在50至200元之间浮动。具体的费用根据商户与支付平台的合作协议而定，可能会存在差异。

另外，需要注意的是，对于交易金额较大的商家，有可能存在特定的费率优惠政策。一些支付平台为了吸引大额交易的商户，可能会提供低于一般手续费率的优惠费率。因此，在商户与支付平台签约前，建议商家详细了解相关的费率政策以及优惠活动，并进行比较和选择。

除此之外，支付平台可能还会根据商户的销售额、交易次数等因素进行评估，并提供相应的费率调整或减免服务，来促进商家的发展和合作。这也意味着，商家可以通过与支付平台保持良好的合作关系，不断提高业务水平，从而获得更多的手续费减免或优惠。

总结起来，商家收款码10000元时需要扣除的手续费在50至200元之间，具体费用根据商户与支付平台的合作协议而定。而实际费用可能受到商户的销售额、交易次数等因素的影响，也可能存在特定的费率优惠政策。因此，商家在选择合作支付平台时，应该全面了解不同平台的费率政策，并根据自身需求选择合适的合作伙伴。同时，商家也应该与支付平台保持良好的合作关系，以获得更多的手续费减免或优惠。